自然生態的廢水處理方法是指利用自然界的機制及生物成員，在人為控制下使其發揮效果能力，來達到處理目標。自然生態的廢水處理方法不需要能源動力輸入及化學藥劑的添加，也沒有污泥產生。只需泵及簡單的管線配置來輸送廢水。下面介紹幾種自然生態的有效的廢水處理方法：

一、廢水穩定塘

廢水穩定塘是利用微生物及較低等的植物與動物來處理廢水，其中生物成員為主要的處理機制，藻類的存在會影響道大多廢水穩定塘系統的處理能效及處理水質。缺點是藻類因光合作用產生氧而提供塘中生物成員的需求，但藻類生產速度快，會導致排放水中有懸浮固體。廢水穩定塘對于有機物、含氮物質及致病菌的去除有效，但是磷的去除效率不高還可能衍生臭氣及蚊子生長等問題。

二、水生生物處理法

水生生物處理法是利用微生物及較高等級的植物或動物來處理廢水，其中生物成員為主要處理機制，這種方式可以利用水生動物貨水產養殖等處理系統，兩者之間形成具有經濟價值的水產養殖動物或植物的收成和廢水處理的目標。

三、濕地處理法

濕地是指每年有不短的時間，地表被水所淹沒且土壤維持飽和濕潤，并且有植物生長的土地，實地具有凈化水質的功能，可以利用的處理廢水的濕地可以是已存在的天然濕地、沼澤、洼地、泥沼及人為構筑用來處理廢水的人工濕地。

四、土地處理法

土地處理法主要是依賴發生在土壤間隙的物理性、化學性及生物性作用。其中，慢速滲濾法及地表慢流法都需要有植物存在，植物可以是樹木、牧草或者蔬菜等。除慢速滲濾法外還有快速滲濾法，快速滲濾法因所操作的水力負荷高，無法提供植物生長。土地處理法產生的處理水可考慮再利用，其中慢滲濾法可以設計成產生飲用水標準的處理水。

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